Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME3Q13232 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NME3Q13232 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME3Q13232 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME3Q13232 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME3Q13232 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME3Q13232 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME3Q13232 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME3Q13232 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME3Q13232 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME3Q13232 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME3Q13232 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME3Q13232 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME3Q13232 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME3Q13232 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME3Q13232 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME3Q13232 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME3Q13232 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME3Q13232 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME3Q13232 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME3Q13232 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NME3Q13232 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME3Q13232 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME3Q13232 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NME3Q13232 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME3Q13232 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME3Q13232 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME3Q13232 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NME3Q13232 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME3Q13232 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NME3Q13232 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME3Q13232 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME3Q13232 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME3Q13232 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME3Q13232 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME3Q13232 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME3Q13232 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME3Q13232 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME3Q13232 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NME3Q13232 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME3Q13232 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME3Q13232 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME3Q13232 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NME3Q13232 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME3Q13232 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NME3Q13232 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME3Q13232 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME3Q13232 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME3Q13232 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME3Q13232 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME3Q13232 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME3Q13232 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME3Q13232 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME3Q13232 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME3Q13232 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME3Q13232 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME3Q13232 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME3Q13232 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME3Q13232 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME3Q13232 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME3Q13232 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME3Q13232 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME3Q13232 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME3Q13232 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME3Q13232 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME3Q13232 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME3Q13232 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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NME3Q13232 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME3Q13232 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME3Q13232 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME3Q13232 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME3Q13232 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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NME3Q13232 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME3Q13232 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME3Q13232 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME3Q13232 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME3Q13232 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME3Q13232 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME3Q13232 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME3Q13232 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME3Q13232 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME3Q13232 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME3Q13232 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME3Q13232 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME3Q13232 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NME3Q13232 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME3Q13232 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME3Q13232 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME3Q13232 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME3Q13232 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME3Q13232 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME3Q13232 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME3Q13232 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME3Q13232 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME3Q13232 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME3Q13232 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME3Q13232 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME3Q13232 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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