Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NFX1Q12986 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFX1Q12986 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
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