Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLEQ07864 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLEQ07864 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLEQ07864 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLEQ07864 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLEQ07864 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLEQ07864 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLEQ07864 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLEQ07864 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLEQ07864 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLEQ07864 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLEQ07864 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLEQ07864 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
POLEQ07864 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLEQ07864 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLEQ07864 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLEQ07864 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLEQ07864 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLEQ07864 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLEQ07864 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLEQ07864 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLEQ07864 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLEQ07864 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLEQ07864 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLEQ07864 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLEQ07864 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLEQ07864 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLEQ07864 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLEQ07864 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLEQ07864 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLEQ07864 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
POLEQ07864 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLEQ07864 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLEQ07864 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLEQ07864 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLEQ07864 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
POLEQ07864 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
POLEQ07864 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
POLEQ07864 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
POLEQ07864 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
POLEQ07864 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLEQ07864 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLEQ07864 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLEQ07864 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLEQ07864 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLEQ07864 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLEQ07864 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLEQ07864 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLEQ07864 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLEQ07864 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLEQ07864 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLEQ07864 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLEQ07864 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLEQ07864 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLEQ07864 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLEQ07864 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLEQ07864 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLEQ07864 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLEQ07864 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLEQ07864 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLEQ07864 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLEQ07864 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLEQ07864 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLEQ07864 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLEQ07864 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLEQ07864 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLEQ07864 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLEQ07864 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLEQ07864 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLEQ07864 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLEQ07864 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
POLEQ07864 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLEQ07864 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
POLEQ07864 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLEQ07864 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLEQ07864 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLEQ07864 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLEQ07864 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLEQ07864 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLEQ07864 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLEQ07864 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLEQ07864 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLEQ07864 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLEQ07864 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLEQ07864 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLEQ07864 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLEQ07864 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLEQ07864 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLEQ07864 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
POLEQ07864 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLEQ07864 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLEQ07864 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
POLEQ07864 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLEQ07864 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLEQ07864 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
POLEQ07864 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLEQ07864 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLEQ07864 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
POLEQ07864 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
POLEQ07864 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms