Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CXCL9Q07325 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms