Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN12Q05209 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTPN12Q05209 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTPN12Q05209 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN12Q05209 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN12Q05209 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN12Q05209 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTPN12Q05209 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN12Q05209 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN12Q05209 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN12Q05209 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN12Q05209 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN12Q05209 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN12Q05209 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN12Q05209 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTPN12Q05209 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN12Q05209 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN12Q05209 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPN12Q05209 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPN12Q05209 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPN12Q05209 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPN12Q05209 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPN12Q05209 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPN12Q05209 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPN12Q05209 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPN12Q05209 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPN12Q05209 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTPN12Q05209 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPN12Q05209 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPN12Q05209 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPN12Q05209 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPN12Q05209 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPN12Q05209 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPN12Q05209 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPN12Q05209 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPN12Q05209 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPN12Q05209 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPN12Q05209 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPN12Q05209 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN12Q05209 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN12Q05209 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN12Q05209 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN12Q05209 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN12Q05209 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN12Q05209 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN12Q05209 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN12Q05209 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN12Q05209 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN12Q05209 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN12Q05209 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN12Q05209 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN12Q05209 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN12Q05209 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN12Q05209 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN12Q05209 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PTPN12Q05209 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN12Q05209 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN12Q05209 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN12Q05209 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN12Q05209 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN12Q05209 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN12Q05209 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PTPN12Q05209 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN12Q05209 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PTPN12Q05209 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN12Q05209 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN12Q05209 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN12Q05209 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN12Q05209 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN12Q05209 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN12Q05209 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN12Q05209 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN12Q05209 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN12Q05209 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN12Q05209 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN12Q05209 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN12Q05209 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN12Q05209 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTPN12Q05209 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN12Q05209 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTPN12Q05209 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN12Q05209 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN12Q05209 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN12Q05209 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTPN12Q05209 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN12Q05209 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN12Q05209 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN12Q05209 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN12Q05209 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN12Q05209 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTPN12Q05209 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN12Q05209 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN12Q05209 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN12Q05209 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN12Q05209 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN12Q05209 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPN12Q05209 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPN12Q05209 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPN12Q05209 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPN12Q05209 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms