Protein–RNA interactions for Protein: P62987

UBA52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA52P62987 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBA52P62987 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBA52P62987 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBA52P62987 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.06■□□□□ 0
UBA52P62987 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UBA52P62987 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBA52P62987 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBA52P62987 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBA52P62987 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBA52P62987 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UBA52P62987 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBA52P62987 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBA52P62987 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBA52P62987 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBA52P62987 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
UBA52P62987 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBA52P62987 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBA52P62987 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
UBA52P62987 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBA52P62987 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBA52P62987 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBA52P62987 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBA52P62987 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
UBA52P62987 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBA52P62987 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
UBA52P62987 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
UBA52P62987 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
UBA52P62987 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UBA52P62987 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
UBA52P62987 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBA52P62987 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UBA52P62987 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBA52P62987 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
UBA52P62987 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UBA52P62987 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
UBA52P62987 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBA52P62987 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBA52P62987 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBA52P62987 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
UBA52P62987 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBA52P62987 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBA52P62987 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBA52P62987 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBA52P62987 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.05■□□□□ -0
UBA52P62987 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UBA52P62987 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.05■□□□□ -0
UBA52P62987 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBA52P62987 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UBA52P62987 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBA52P62987 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UBA52P62987 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UBA52P62987 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
UBA52P62987 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBA52P62987 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UBA52P62987 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBA52P62987 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UBA52P62987 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBA52P62987 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBA52P62987 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBA52P62987 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBA52P62987 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UBA52P62987 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UBA52P62987 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBA52P62987 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBA52P62987 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBA52P62987 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
UBA52P62987 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UBA52P62987 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UBA52P62987 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UBA52P62987 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UBA52P62987 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBA52P62987 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UBA52P62987 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UBA52P62987 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBA52P62987 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UBA52P62987 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UBA52P62987 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.04■□□□□ -0
UBA52P62987 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.04■□□□□ -0
UBA52P62987 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
UBA52P62987 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
UBA52P62987 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
UBA52P62987 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.04■□□□□ -0
UBA52P62987 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.04■□□□□ -0
UBA52P62987 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UBA52P62987 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UBA52P62987 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UBA52P62987 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UBA52P62987 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UBA52P62987 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBA52P62987 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBA52P62987 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UBA52P62987 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBA52P62987 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBA52P62987 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBA52P62987 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UBA52P62987 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBA52P62987 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBA52P62987 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
UBA52P62987 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBA52P62987 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms