Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DAP3P51398 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DAP3P51398 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DAP3P51398 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DAP3P51398 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DAP3P51398 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DAP3P51398 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DAP3P51398 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DAP3P51398 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DAP3P51398 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DAP3P51398 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DAP3P51398 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DAP3P51398 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DAP3P51398 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DAP3P51398 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DAP3P51398 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DAP3P51398 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DAP3P51398 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DAP3P51398 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DAP3P51398 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DAP3P51398 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DAP3P51398 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DAP3P51398 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DAP3P51398 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DAP3P51398 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DAP3P51398 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DAP3P51398 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DAP3P51398 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DAP3P51398 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DAP3P51398 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DAP3P51398 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DAP3P51398 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DAP3P51398 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DAP3P51398 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DAP3P51398 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DAP3P51398 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DAP3P51398 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DAP3P51398 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DAP3P51398 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DAP3P51398 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DAP3P51398 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DAP3P51398 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DAP3P51398 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DAP3P51398 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DAP3P51398 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DAP3P51398 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DAP3P51398 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DAP3P51398 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DAP3P51398 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DAP3P51398 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DAP3P51398 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DAP3P51398 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DAP3P51398 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DAP3P51398 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DAP3P51398 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DAP3P51398 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DAP3P51398 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DAP3P51398 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DAP3P51398 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DAP3P51398 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DAP3P51398 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DAP3P51398 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DAP3P51398 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DAP3P51398 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DAP3P51398 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DAP3P51398 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DAP3P51398 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DAP3P51398 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DAP3P51398 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DAP3P51398 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DAP3P51398 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DAP3P51398 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DAP3P51398 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DAP3P51398 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DAP3P51398 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DAP3P51398 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DAP3P51398 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DAP3P51398 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DAP3P51398 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DAP3P51398 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DAP3P51398 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DAP3P51398 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DAP3P51398 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DAP3P51398 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DAP3P51398 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DAP3P51398 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DAP3P51398 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DAP3P51398 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DAP3P51398 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DAP3P51398 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DAP3P51398 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DAP3P51398 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DAP3P51398 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DAP3P51398 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DAP3P51398 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DAP3P51398 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DAP3P51398 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DAP3P51398 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DAP3P51398 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DAP3P51398 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms