Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms