Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms