Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSSP25774 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSSP25774 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSSP25774 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSSP25774 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSSP25774 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSSP25774 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSSP25774 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSSP25774 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSSP25774 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSSP25774 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSSP25774 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSSP25774 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSSP25774 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSSP25774 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSSP25774 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSSP25774 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSSP25774 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSSP25774 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSSP25774 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSSP25774 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSSP25774 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSSP25774 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSSP25774 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSSP25774 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSSP25774 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSSP25774 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSSP25774 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTSSP25774 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTSSP25774 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTSSP25774 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTSSP25774 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTSSP25774 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTSSP25774 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTSSP25774 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTSSP25774 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTSSP25774 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTSSP25774 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTSSP25774 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTSSP25774 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTSSP25774 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTSSP25774 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTSSP25774 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTSSP25774 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTSSP25774 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTSSP25774 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTSSP25774 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTSSP25774 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTSSP25774 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTSSP25774 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTSSP25774 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTSSP25774 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTSSP25774 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTSSP25774 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTSSP25774 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTSSP25774 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTSSP25774 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTSSP25774 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTSSP25774 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTSSP25774 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTSSP25774 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTSSP25774 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTSSP25774 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTSSP25774 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CTSSP25774 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTSSP25774 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CTSSP25774 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTSSP25774 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTSSP25774 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTSSP25774 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTSSP25774 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTSSP25774 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTSSP25774 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CTSSP25774 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTSSP25774 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTSSP25774 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTSSP25774 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTSSP25774 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTSSP25774 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CTSSP25774 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTSSP25774 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTSSP25774 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTSSP25774 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTSSP25774 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTSSP25774 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTSSP25774 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTSSP25774 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTSSP25774 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTSSP25774 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTSSP25774 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTSSP25774 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTSSP25774 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTSSP25774 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CTSSP25774 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSSP25774 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSSP25774 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSSP25774 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSSP25774 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSSP25774 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSSP25774 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms