Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
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