Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
FANCAO15360 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
FANCAO15360 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
FANCAO15360 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
FANCAO15360 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
FANCAO15360 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FANCAO15360 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FANCAO15360 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FANCAO15360 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FANCAO15360 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FANCAO15360 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FANCAO15360 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FANCAO15360 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
FANCAO15360 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
FANCAO15360 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FANCAO15360 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FANCAO15360 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FANCAO15360 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FANCAO15360 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FANCAO15360 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FANCAO15360 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FANCAO15360 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FANCAO15360 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FANCAO15360 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FANCAO15360 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FANCAO15360 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FANCAO15360 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FANCAO15360 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FANCAO15360 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FANCAO15360 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FANCAO15360 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FANCAO15360 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FANCAO15360 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FANCAO15360 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FANCAO15360 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FANCAO15360 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
FANCAO15360 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FANCAO15360 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FANCAO15360 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FANCAO15360 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FANCAO15360 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FANCAO15360 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FANCAO15360 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FANCAO15360 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FANCAO15360 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FANCAO15360 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FANCAO15360 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FANCAO15360 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FANCAO15360 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FANCAO15360 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FANCAO15360 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FANCAO15360 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FANCAO15360 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FANCAO15360 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FANCAO15360 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
FANCAO15360 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FANCAO15360 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FANCAO15360 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FANCAO15360 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FANCAO15360 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FANCAO15360 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FANCAO15360 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FANCAO15360 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FANCAO15360 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FANCAO15360 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FANCAO15360 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FANCAO15360 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FANCAO15360 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FANCAO15360 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FANCAO15360 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FANCAO15360 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FANCAO15360 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
FANCAO15360 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FANCAO15360 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FANCAO15360 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
FANCAO15360 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FANCAO15360 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
FANCAO15360 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FANCAO15360 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FANCAO15360 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FANCAO15360 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FANCAO15360 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FANCAO15360 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FANCAO15360 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FANCAO15360 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FANCAO15360 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
FANCAO15360 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FANCAO15360 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FANCAO15360 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FANCAO15360 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FANCAO15360 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FANCAO15360 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
FANCAO15360 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
FANCAO15360 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FANCAO15360 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FANCAO15360 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FANCAO15360 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FANCAO15360 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FANCAO15360 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FANCAO15360 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms