Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms