Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DXG7 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DXG7 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DXG7 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DXG7 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DXG7 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DXG7 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DXG7 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DXG7 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DXG7 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DXG7 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DXG7 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DXG7 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DXG7 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DXG7 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DXG7 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DXG7 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DXG7 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DXG7 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DXG7 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DXG7 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DXG7 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DXG7 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
B4DXG7 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
B4DXG7 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
B4DXG7 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
B4DXG7 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
B4DXG7 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
B4DXG7 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
B4DXG7 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
B4DXG7 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
B4DXG7 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
B4DXG7 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
B4DXG7 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
B4DXG7 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
B4DXG7 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
B4DXG7 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
B4DXG7 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
B4DXG7 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
B4DXG7 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
B4DXG7 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
B4DXG7 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
B4DXG7 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
B4DXG7 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
B4DXG7 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
B4DXG7 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
B4DXG7 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
B4DXG7 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
B4DXG7 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
B4DXG7 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
B4DXG7 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
B4DXG7 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
B4DXG7 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
B4DXG7 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
B4DXG7 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
B4DXG7 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
B4DXG7 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
B4DXG7 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
B4DXG7 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
B4DXG7 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
B4DXG7 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
B4DXG7 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
B4DXG7 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
B4DXG7 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
B4DXG7 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
B4DXG7 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
B4DXG7 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
B4DXG7 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
B4DXG7 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
B4DXG7 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
B4DXG7 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
B4DXG7 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
B4DXG7 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
B4DXG7 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
B4DXG7 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
B4DXG7 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
B4DXG7 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
B4DXG7 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
B4DXG7 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
B4DXG7 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
B4DXG7 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
B4DXG7 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
B4DXG7 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
B4DXG7 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
B4DXG7 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
B4DXG7 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
B4DXG7 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
B4DXG7 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
B4DXG7 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
B4DXG7 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
B4DXG7 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
B4DXG7 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
B4DXG7 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
B4DXG7 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
B4DXG7 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
B4DXG7 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
B4DXG7 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
B4DXG7 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
B4DXG7 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
B4DXG7 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms