Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms