Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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