Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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