Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI7

KRCC1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRCC1Q9NPI7 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRCC1Q9NPI7 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms