Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRRTQ9BXP5 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms