Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FRAT1Q92837 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms