Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC4Q8N9L1 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms