Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms