Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00299Q6ZSB3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms