Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITRM1Q5JRX3 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms