Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF1Q3BBV0 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF1Q3BBV0 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF1Q3BBV0 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF1Q3BBV0 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF1Q3BBV0 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF1Q3BBV0 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF1Q3BBV0 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF1Q3BBV0 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF1Q3BBV0 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF1Q3BBV0 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF1Q3BBV0 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NBPF1Q3BBV0 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NBPF1Q3BBV0 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NBPF1Q3BBV0 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NBPF1Q3BBV0 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NBPF1Q3BBV0 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NBPF1Q3BBV0 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NBPF1Q3BBV0 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NBPF1Q3BBV0 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NBPF1Q3BBV0 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NBPF1Q3BBV0 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NBPF1Q3BBV0 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NBPF1Q3BBV0 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NBPF1Q3BBV0 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NBPF1Q3BBV0 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NBPF1Q3BBV0 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NBPF1Q3BBV0 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NBPF1Q3BBV0 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NBPF1Q3BBV0 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NBPF1Q3BBV0 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NBPF1Q3BBV0 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms