Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms