Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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