Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDH18Q13634 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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