Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NEUROD1Q13562 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
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