Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRDM2Q13029 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
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