Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms