Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN12Q05209 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PTPN12Q05209 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTPN12Q05209 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTPN12Q05209 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PTPN12Q05209 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN12Q05209 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN12Q05209 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN12Q05209 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN12Q05209 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN12Q05209 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTPN12Q05209 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN12Q05209 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN12Q05209 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN12Q05209 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms