Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms