Protein–RNA interactions for Protein: P62316

SNRPD2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD2P62316 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPD2P62316 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SNRPD2P62316 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SNRPD2P62316 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SNRPD2P62316 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms