Protein–RNA interactions for Protein: P59037

LINC00313, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00313, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00313P59037 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms