Protein–RNA interactions for Protein: P58304

VSX2, Visual system homeobox 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX2P58304 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VSX2P58304 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VSX2P58304 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VSX2P58304 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VSX2P58304 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
VSX2P58304 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VSX2P58304 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VSX2P58304 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VSX2P58304 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VSX2P58304 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VSX2P58304 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VSX2P58304 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
VSX2P58304 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VSX2P58304 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VSX2P58304 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VSX2P58304 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VSX2P58304 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VSX2P58304 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VSX2P58304 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VSX2P58304 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VSX2P58304 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VSX2P58304 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VSX2P58304 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VSX2P58304 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VSX2P58304 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VSX2P58304 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VSX2P58304 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VSX2P58304 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VSX2P58304 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VSX2P58304 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VSX2P58304 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VSX2P58304 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VSX2P58304 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VSX2P58304 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VSX2P58304 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VSX2P58304 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VSX2P58304 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VSX2P58304 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VSX2P58304 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VSX2P58304 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VSX2P58304 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VSX2P58304 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VSX2P58304 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VSX2P58304 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VSX2P58304 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VSX2P58304 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VSX2P58304 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VSX2P58304 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VSX2P58304 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VSX2P58304 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VSX2P58304 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VSX2P58304 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VSX2P58304 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VSX2P58304 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VSX2P58304 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VSX2P58304 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VSX2P58304 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VSX2P58304 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VSX2P58304 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VSX2P58304 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VSX2P58304 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VSX2P58304 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VSX2P58304 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VSX2P58304 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VSX2P58304 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VSX2P58304 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VSX2P58304 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VSX2P58304 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VSX2P58304 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VSX2P58304 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VSX2P58304 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VSX2P58304 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VSX2P58304 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VSX2P58304 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VSX2P58304 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VSX2P58304 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VSX2P58304 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VSX2P58304 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VSX2P58304 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
VSX2P58304 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VSX2P58304 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VSX2P58304 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VSX2P58304 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VSX2P58304 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VSX2P58304 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VSX2P58304 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
VSX2P58304 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VSX2P58304 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VSX2P58304 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VSX2P58304 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VSX2P58304 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VSX2P58304 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VSX2P58304 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VSX2P58304 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VSX2P58304 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VSX2P58304 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VSX2P58304 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VSX2P58304 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VSX2P58304 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VSX2P58304 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms