Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
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PGGT1BP53609 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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