Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GNPDA1P46926 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms