Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms