Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFTPDP35247 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms