Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms