Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms