Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMY2BP19961 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms