Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms