Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPRP12270 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPRP12270 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPRP12270 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPRP12270 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPRP12270 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPRP12270 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPRP12270 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPRP12270 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPRP12270 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPRP12270 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPRP12270 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPRP12270 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPRP12270 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPRP12270 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPRP12270 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPRP12270 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPRP12270 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPRP12270 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPRP12270 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPRP12270 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPRP12270 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPRP12270 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPRP12270 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPRP12270 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPRP12270 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPRP12270 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPRP12270 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPRP12270 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPRP12270 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPRP12270 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPRP12270 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPRP12270 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPRP12270 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPRP12270 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPRP12270 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPRP12270 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPRP12270 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPRP12270 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPRP12270 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPRP12270 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPRP12270 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPRP12270 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPRP12270 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPRP12270 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPRP12270 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPRP12270 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPRP12270 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPRP12270 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPRP12270 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPRP12270 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPRP12270 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TPRP12270 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TPRP12270 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPRP12270 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPRP12270 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPRP12270 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPRP12270 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPRP12270 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPRP12270 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TPRP12270 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TPRP12270 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPRP12270 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPRP12270 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPRP12270 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TPRP12270 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPRP12270 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TPRP12270 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TPRP12270 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPRP12270 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPRP12270 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPRP12270 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPRP12270 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPRP12270 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPRP12270 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPRP12270 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPRP12270 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPRP12270 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPRP12270 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPRP12270 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPRP12270 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPRP12270 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPRP12270 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPRP12270 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPRP12270 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPRP12270 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPRP12270 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPRP12270 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPRP12270 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPRP12270 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPRP12270 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPRP12270 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPRP12270 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TPRP12270 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPRP12270 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPRP12270 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPRP12270 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPRP12270 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPRP12270 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPRP12270 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms