Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC11□□□□□ -0.65
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PKHD1P08F94 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC11□□□□□ -0.65
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PKHD1P08F94 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC11□□□□□ -0.65
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PKHD1P08F94 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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PKHD1P08F94 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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PKHD1P08F94 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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PKHD1P08F94 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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PKHD1P08F94 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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