Protein–RNA interactions for Protein: O95260

ATE1, Arginyl-tRNA--protein transferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATE1O95260 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATE1O95260 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATE1O95260 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATE1O95260 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATE1O95260 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATE1O95260 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATE1O95260 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATE1O95260 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATE1O95260 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATE1O95260 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATE1O95260 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATE1O95260 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATE1O95260 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATE1O95260 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATE1O95260 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATE1O95260 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATE1O95260 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATE1O95260 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATE1O95260 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATE1O95260 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATE1O95260 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATE1O95260 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATE1O95260 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATE1O95260 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATE1O95260 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATE1O95260 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATE1O95260 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATE1O95260 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATE1O95260 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATE1O95260 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATE1O95260 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATE1O95260 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATE1O95260 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATE1O95260 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATE1O95260 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATE1O95260 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATE1O95260 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATE1O95260 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATE1O95260 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATE1O95260 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATE1O95260 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATE1O95260 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATE1O95260 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATE1O95260 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATE1O95260 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATE1O95260 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATE1O95260 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATE1O95260 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATE1O95260 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATE1O95260 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATE1O95260 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATE1O95260 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATE1O95260 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATE1O95260 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATE1O95260 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATE1O95260 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATE1O95260 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATE1O95260 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATE1O95260 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATE1O95260 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATE1O95260 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATE1O95260 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATE1O95260 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATE1O95260 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATE1O95260 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATE1O95260 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATE1O95260 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATE1O95260 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATE1O95260 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATE1O95260 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATE1O95260 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATE1O95260 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATE1O95260 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATE1O95260 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATE1O95260 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATE1O95260 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATE1O95260 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATE1O95260 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATE1O95260 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATE1O95260 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATE1O95260 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATE1O95260 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATE1O95260 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATE1O95260 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATE1O95260 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATE1O95260 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATE1O95260 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATE1O95260 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATE1O95260 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATE1O95260 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATE1O95260 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATE1O95260 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATE1O95260 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATE1O95260 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATE1O95260 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATE1O95260 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATE1O95260 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATE1O95260 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATE1O95260 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATE1O95260 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms