Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVV-1B6SEH8 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms