Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms