Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X0

SNX10, Sorting nexin-10, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX10Q9Y5X0 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX10Q9Y5X0 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms